12 grudnia 2011 Trybunał Konstytucyjny rozpoznał pytanie prawne Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Łodzi dotyczące systemów realizacji regionalnych programów operacyjnych. Trybunał orzekł, że art.5 pkt 11, art.30b ust. 1 zdanie pierwsze i ust. 2 oraz art. 30c ust. 1 ustawy z dnia 6 grudnia 2006 r. o zasadach prowadzenia polityki rozwoju są niezgodne z art. 87 konstytucji, który wymienia źródła powszechnie obowiązującego w Polsce prawa.

Trybunał stwierdził, że wskazane powyżej przepisy ustawy dają możliwość regulowania zasad i procedur dotyczących m.in. konkursów na dofinansowanie projektów ze środków unijnych w dokumentach programowych poszczególnych programów operacyjnych (np. w Szczegółowym Opisie Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki). Określają one nie tylko kompetencje instytucji publicznych odpowiedzialnych za realizację konkursów, ale także sytuację uczestników konkursów, którymi są zarówno instytucje publiczne, jak też osoby fizyczne, przedsiębiorcy czy organizacje pozarządowe.

Dokumenty programowe mają charakter wewnętrzny i nie są źródłami powszechnie obowiązującego prawa w rozumieniu konstytucji. Mogą więc regulować jedynie działalność podmiotów administracji publicznej podległych organom wydającym te dokumenty, niedopuszczalne jest, aby określały one sytuację podmiotów zewnętrznych wobec tych organów. Dopuszczenie takiej możliwości jest niezgodne z konstytucją, gdyż prawa i obowiązki uczestników konkursów organizowanych w ramach programów operacyjnych mogą być normowane wyłącznie w aktach powszechnie obowiązującego prawa (np. ustawach czy rozporządzeniach). Trybunał zwrócił również uwagę, że tryb zaskarżania decyzji dotyczących oceny projektów konkursowych musi być również unormowany ustawowo.

Orzeczenie Trybunału oznacza, że zasady i procedury dotyczące konkursów na dofinansowanie projektów ze środków unijnych muszą zostać określone w ustawach i/lub rozporządzeniach. To z pewnością wzmocni pozycję uczestnika konkursu, ograniczy dowolność interpretacji zasad i procedur konkursowych przez instytucje organizujące konkursy, stworzy także skuteczniejszy mechanizm odwoławczy od ich decyzji. Ale stanie się to najpóźniej za półtora roku, gdyż Trybunał Konstytucyjny przychylił się do argumentów Ministra Rozwoju Regionalnego i orzekł, że niezgodne z konstytucją przepisy obowiązywać mogą jeszcze przez 18 miesięcy od dnia ogłoszenia wyroku w Dzienniku Ustaw.